GKI mengaku imannya bahwa Yesus Kristus adalah :
1. Tuhan dan Juruselamat dunia, Sumber kebenaran dan hidup
2. Kepala Gereja, yang mendirikan gereja dan memanggil gereja untuk hidup dalam iman dan misinya.
GKI mengaku bahwa Alkitab Perjanjian Lama dan Perjanjian Baru adalah Firman Allah, yang menjadi dasar dan norma satu-satunya bagi kehidupan gereja.
Dalam persekutuan dengan Gereja Tuhan Yesus Kristus di segala abad dan tempat, GKI menerima Pengakuan Iman Rasuli, Pengakuan Iman Nicea Konstantinopel, dan Pengakuan Iman Athanasius.
GKI dalam ikatan dengan tradisi Reformasi, menerima Katekismus Heidelberg.